INNER CODE UNIT · Python

generate_streaming_otu_table_from_args

wwood/singlem · singlem/main.py:276

def generate_streaming_otu_table_from_args(args,
    input_prefix=False, query_prefix=False, archive_only=False, min_archive_otu_table_version=None):

    if archive_only:
        otu_tables = False
        otu_tables_list = False
    if input_prefix:
        if not archive_only:
            otu_tables = args.input_otu_tables
            otu_tables_list = args.input_otu_tables_list
        archive_otu_tables = args.input_archive_otu_tables
        archive_otu_table_list = args.input_archive_otu_table_list
        gzip_archive_otu_table_list = args.input_gzip_archive_otu_table_list
    elif query_prefix:
        otu_tables = args.query_otu_table
        otu_tables_list = args.query_otu_tables_list
        archive_otu_tables = args.query_archive_otu_tables
        archive_otu_table_list = args.query_archive_otu_table_list

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